Институт теоретической физики им. Л.Д. Ландау РАН
L.D. Landau Institute for Theoretical Physics RAS
Landau Days 2022 June, 27-30, 2022 Chernogolovka, Russia

Влияние активного выпетливания на статистику парных контактов в модели интерфазных хромосом
Date/Time: 12:00 27-Jun-2022
Abstract:
Анализ данных экспериментальных техник определения конформации хромосом привел к формированию продолжающего обогащаться представления о пространственной структуре генома и вскрытию одного из ключевых определяющих ее механизмов - активного выпетливания. Проведенные в последние несколько лет эксперименты наглядно продемонстрировали, что присутствующие в нуклеоплазме ядер клеток кольцеобразные белковые SMC-белки (конденсин и когезин), связываясь с ДНК, способны в присутствии АТФ проявлять моторную активность, которая приводит к образованию и росту петель ДНК. Вскрытие молекулярного механизма активного выпетливания открывает перспективы построения аналитической теории способной систематизировать существующие данные Hi-C метода касательно частот парных физических контактов между различными участками генома. В этой работе мы теоретически исследуем статистику парных контактов в модели идеальной полимерной цепи с беспорядком случайных петель. Показано, что данная модель воспроизводит характерный для интерфазных хромосом млекопитающих профиль вероятности контакта как функцию от геномного расстояния, позволяя оценить характерную контурную длину созданных моторной активностью когезиновых комплексов петель.



Authors
Belan Sergey Alexandrovich (Presenter)
(no additional information)

© 2012, Landau Institute for Theoretical Physics RAS www.itp.ac.ru
Contact webmaster